복수 법인을 운영할 때 세무상 놓치기 쉬운 포인트

복수 법인을 운영할 때 세무상 놓치기 쉬운 포인트

음... 요즘 정말 많은 분들이 여러 개의 회사를 운영하고 계시더라고요. 그런데 말이죠, 이럴 때 세무 처리가 생각보다 복잡하다는 걸 아시나요? 😅



제가 이런 저런 사례들을 보면서 느낀 건데요, 정말 정말 놓치기 쉬운 포인트들이 있어요. 오늘은 그런 부분들을 하나씩 짚어보려고 해요!



🏢 특수관계자 규정, 이거 정말 중요해요

그러니까.. 그러니까 이걸 이렇게 설명해볼게요. 여러 개 기업을 운영하면 자연스럽게 서로 거래를 하게 되잖아요? 그런데 이때 가장 주의해야 할 게 바로 특수관계자 규정이에요.



여기서 중요한 점은 조세특례제한법 제104조의14에 따르면, 특수관계자 간 거래에서는 정상가격으로 거래해야 한다는 거예요.



아~ 이게 무슨 말이냐면요, A회사와 B회사가 모두 본인 소유라고 해서 막 싸게 거래하거나 비싸게 거래하면 안 된다는 뜻이에요. 시장가격으로 해야 해요! 💡



실무 팁 📝
• 거래 시마다 시장가격 조사해서 기록 남기기
• 계약서에 가격 산정 근거 명시하기
• 정기적으로 가격 적정성 검토하기

💰 중소기업 세액감면, 놓치면 아까워요

그런데 이거 아세요? 복수 기업을 운영할 때 중소기업 혜택을 받으려면 조건이 있어요. 많은 분들이 이 부분을 간과하시더라고요.



조세특례제한법 제5조에 보면, 중소기업 판정할 때 특수관계자가 소유한 다른 회사들의 매출액도 합산해서 봐요. 그러니까 A회사 매출이 10억, B회사 매출이 20억이면 총 30억으로 판정한다는 거죠!



Q: 그럼 중소기업 혜택을 못 받는 건가요?
A: 아니에요! 각 회사별로 조건만 맞으면 받을 수 있어요. 다만 합산 매출액 기준을 적용한다는 점만 주의하시면 돼요. 😊



  • 제조업: 연평균 매출액 1,500억원 미만
  • 서비스업: 연평균 매출액 800억원 미만
  • 도소매업: 연평균 매출액 1,000억원 미만

📊 손익통산, 이건 절대 안 돼요

참, 그러고 보니 이것도 말씀드려야겠네요. 이건 진짜 꿀팁이에요! 아니, 사실 주의사항이라고 해야겠네요. 😅



여러 개 회사를 운영하다 보면 A회사는 이익이 나고 B회사는 손실이 날 수 있잖아요? 그때 "아, 그럼 합쳐서 세금 내면 되겠네!" 이렇게 생각하시는 분들이 계세요.



글쎄요... 이건 좀 아닌 것 같아요. 각 기업은 독립된 납세의무자라서 개별적으로 세금을 계산해야 해요.



⚠️ 주의사항
법인세법 제13조에 따르면, 각 법인은 독립된 과세주체로 보기 때문에 손익통산은 불가능해요. 연결납세제도가 있긴 하지만, 이건 별도의 요건을 갖춰야 하고요.

🔄 자금 이동과 대여금 처리

음~ 이 부분도 정말 정말 조심해야 할 부분이에요. 복수 기업을 운영하다 보면 자금이 부족한 회사에 다른 회사에서 돈을 빌려주는 경우가 많거든요.



그런데 말이죠, 이때 이자를 안 받거나 너무 낮게 받으면 문제가 될 수 있어요. 세무서에서는 "정상적인 이자율을 적용해야 한다"고 보거든요.



실제로 어떻게 해야 할까요?


  • 시중 금융기관 대출금리 수준으로 이자 설정하기
  • 대여계약서 작성해서 조건 명확히 하기
  • 이자 지급을 실제로 이행하기 (장부상으로만 하지 말고!)
  • 원금 상환 계획도 세워두기



아! 맞다! 중요한 얘기가 하나 더 있어요. 만약 이자를 안 받으면 그 금액만큼 증여세 문제가 생길 수도 있어요. 그쵸? 😰



📋 부가가치세 신고, 이것도 체크해보세요

그런데 이거 많이 헷갈리시더라고요. 복수 기업 간 거래할 때 부가세 처리 말이에요.



부가가치세법 제6조를 보면, 재화나 용역을 공급할 때는 부가세를 내야 해요. 설령 본인이 소유한 회사들끼리 거래하더라도 마찬가지예요!



제 생각에는 이 부분을 많은 분들이 놓치시는 것 같아요. "어차피 내 회사들끼리 하는 거래인데 뭘~" 이렇게 생각하시거든요. 하지만 세법상으로는 별개 사업자로 봐요.



💡 실무 포인트
• 계산서 발행을 빼먹지 마세요
• 부가세 신고 시 매출·매입 모두 정확히 기재하기
• 면세사업자라도 계산서는 발행해야 해요

음... 어떻게 설명하면 좋을까요? 복수 기업 운영할 때는 정말 신경 쓸 게 많아요. 하지만 이런 포인트들만 잘 챙기시면 크게 문제될 건 없을 거예요. 😊



그런데 말이죠, 세법은 정말 자주 바뀌거든요. 그래서 중요한 결정을 내리실 때는 꼭 전문가와 상담해보시는 걸 추천드려요. 혼자서 다 하려고 하지 마시고요!



이 정보는 2025년 11월 기준이며, 법령은 변경될 수 있으니 중요한 결정 전에 전문가와 상담하세요. 여러분의 사업이 더욱 번창하길 바라요! 🚀


복수 법인을 운영할 때 세무상 놓치기 쉬운 포인트

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